Bert Joris a commencé à étudier la musique très jeune. Il a d'abord joué du piano et du violon, mais finalement, à l'âge de quatorze ans, il s'est tourné vers la trompette. Il a suivi une formation classique au conservatoire de musique d'Anvers, même si le jazz exerçait sur lui une plus grande attraction, s'agissant d'un style mieux adapté au développement de ses talents créatifs. De 1978 à 1987, il a collaboré avec le BRT Jazz Orchestra, alors dirigé par Etienne Verscheuren. Initialement, il y jouait de la trompette, mais il s'est également fait remarquer comme compositeur et arrangeur pour finalement devenir chef d'orchestre invité. Parallèlement, Bert Joris a continué à bâtir sa réputation de pédagogue. En 1987, cela l'a conduit à un poste de professeur à la célèbre Swiss Jazz School de Berne. À peu près à la même époque, il a lancé un cours de jazz au Lemmensinstituut de Louvain, qui a progressivement évolué pour devenir l'actuel département de jazz de l'école. De 1990 à 1992, il a été professeur de trompette au Conservatoire de Hilversum. En 1992, Bert Joris a entamé une collaboration intense avec le guitariste belge Philip Catherine. Il s'est également produit avec de nombreux autres musiciens et ensembles. Il a tourné en Europe avec les ensembles de Rob van Bavel, Robert Jan Vermeulen, Wolfgang Haffner, Ricardo del Fra, Michel Herr, Enrico Pieranunzi, Joe Haider et l'Act Big Band. En outre, il a fondé le Bert Joris Quartet (avec le pianiste Dado Moroni, le batteur Dre Pallemaerts et le contrebassiste Philippe Aerts). Il est souvent invité comme soliste et/ou comme compositeur-chef d'orchestre par de grandes formations européennes et des big bands tels que ceux de Klaus Weiss, Al Porcino, le Concertgebouw Jazz Orchestra, le Metropoolorkest et bien d'autres.